Найпоширенішими організмами, що живуть у мезопелагічній зоні, є гетеротрофні бактерії. У цій зоні живуть риба-меч, кальмари, вовчки і деякі види каламутиць. Багато організмів, що живуть тут, є біолюмінесцентними. Деякі мезопелагічні істоти піднімаються в епіпелагіальну зону вночі, щоб харчуватися.