Встановлені філогенетичною систематикою, часто описують еволюційну історію видів і, відтепер, його філогенез, історичні взаємини серед гілок організмів або їх частин, наприклад їх генів. Філогенетична таксономія, яка є відгалуженням, але не логічним продовженням, філогенетичної систематики, займається класифікацією груп організмів згідно зі ступенем їхніх еволюційних відносин.

гр. φῦλον «нарід, рід, плем'я» [< праіндоєвр. *bʰuHyéti «ставати, рости, з'являтися» < *bʰuH- «з'явитися, стати, піднятися» > укр. бу́ти] + γίγνομαι «народжуватися»