Варіант «Афанасій» вважається канонічним церковним ім'ям (у західних областях поширеніший варіант «Атанасій»). Вживаними в Україні варіантами цього імені є Опанас і Панас, що утворилися в народному мовленні через заміну первісно невластивої слов'янським мовам фонеми /f/ на /p/ (а перший варіант, крім того, заміною початкового /a/ на /o/, як в інших грецьких іменах Олександр, Олексій, Оникій та ін.), а також Атанас.

гр. Ἀϑανάσιος походить від прикметника ἀϑάνατος «безсмертний», утвореного з заперечної частки ἀ- «не-, без-» та іменника ϑάνατος «смерть», спорідненого з дінд.áadhvanīt «він згас, він зник», dhvāntáḥ «темний, похмурий», ірл. du(i)ne «смертний»